医院信息化建设是一个庞大的系统工程，常被拆分为多个核心子系统。数据表明，不同系统之间的投入成本差异显著。根据行业统计，在2025年的医院信息化项目中，医院信息系统（HIS）的平均初始部署成本约为120万元，而电子病历系统（EMR）的投入则高达250万元，后者约为前者的2.1倍。

从长期运维角度看，影像归档和通信系统（PACS）的投入规模最为惊人。由于其需要处理海量影像数据，存储设备与带宽的年度成本平均占总体信息化预算的18%，远高于实验室信息系统（LIS）的9%。临床信息系统（CIS）则因其复杂的集成逻辑和数据交换需求，每年的升级服务费用比HIS高出约35%，是典型的高维护成本项目。

综合来看，若将五大系统的5年总拥有成本（TCO）进行对比，EMR系统以平均580万元位居榜首，PACS以510万元紧随其后。相比之下，HIS的5年TCO仅为320万元，显示出其在基础架构上的成本优势。因此，对于预算有限的医院，优先部署HIS和LIS是性价比之选；而追求诊疗深度的三甲医院，则不得不将重金砸向EMR和PACS领域。